MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip01

Total Repeats: 1217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012970	GCAA	2	8	63697	63704	50 %	0 %	25 %	25 %	254003195
1002	NC_012970	TCG	2	6	63707	63712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003195
1003	NC_012970	GCC	2	6	63838	63843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003195
1004	NC_012970	CAA	2	6	63921	63926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003195
1005	NC_012970	ATT	2	6	63941	63946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003195
1006	NC_012970	TTC	2	6	64113	64118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003196
1007	NC_012970	TGAA	2	8	64154	64161	50 %	25 %	25 %	0 %	254003196
1008	NC_012970	TTTC	2	8	64178	64185	0 %	75 %	0 %	25 %	254003196
1009	NC_012970	TGG	2	6	64302	64307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003196
1010	NC_012970	AAAT	2	8	64353	64360	75 %	25 %	0 %	0 %	254003196
1011	NC_012970	CCT	2	6	64384	64389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254003196
1012	NC_012970	AATG	2	8	64438	64445	50 %	25 %	25 %	0 %	254003196
1013	NC_012970	AAT	2	6	64536	64541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003196
1014	NC_012970	TTG	2	6	64547	64552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003196
1015	NC_012970	AAT	2	6	64561	64566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003196
1016	NC_012970	TAA	2	6	64602	64607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003196
1017	NC_012970	GA	3	6	64624	64629	50 %	0 %	50 %	0 %	254003196
1018	NC_012970	AAT	2	6	64631	64636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003196
1019	NC_012970	CTT	2	6	64650	64655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003197
1020	NC_012970	TGCCT	2	10	64658	64667	0 %	40 %	20 %	40 %	254003197
1021	NC_012970	A	6	6	64763	64768	100 %	0 %	0 %	0 %	254003197
1022	NC_012970	CCA	2	6	64852	64857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003197
1023	NC_012970	ACC	2	6	64862	64867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003197
1024	NC_012970	GCAC	2	8	64884	64891	25 %	0 %	25 %	50 %	254003197
1025	NC_012970	CAAT	2	8	64897	64904	50 %	25 %	0 %	25 %	254003197
1026	NC_012970	CAA	2	6	64993	64998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003197
1027	NC_012970	AGT	2	6	65039	65044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003197
1028	NC_012970	GCA	2	6	65154	65159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003197
1029	NC_012970	GAA	2	6	65181	65186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003197
1030	NC_012970	GAT	2	6	65187	65192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003197
1031	NC_012970	TCT	2	6	65310	65315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003197
1032	NC_012970	ACT	2	6	65352	65357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003197
1033	NC_012970	GAA	2	6	65421	65426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003197
1034	NC_012970	AGT	2	6	65459	65464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003197
1035	NC_012970	CAG	3	9	65538	65546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003197
1036	NC_012970	CAAG	2	8	65807	65814	50 %	0 %	25 %	25 %	254003197
1037	NC_012970	CAT	2	6	65833	65838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003197
1038	NC_012970	CAC	2	6	65846	65851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003197
1039	NC_012970	CAA	2	6	65855	65860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003197
1040	NC_012970	GGTC	2	8	65879	65886	0 %	25 %	50 %	25 %	254003197
1041	NC_012970	CTT	2	6	65905	65910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003197
1042	NC_012970	TAC	2	6	65948	65953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003197
1043	NC_012970	GCCTG	2	10	65960	65969	0 %	20 %	40 %	40 %	254003197
1044	NC_012970	ACC	2	6	66069	66074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254003197
1045	NC_012970	TTG	2	6	66163	66168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003197
1046	NC_012970	T	6	6	66366	66371	0 %	100 %	0 %	0 %	254003198
1047	NC_012970	AAG	2	6	66404	66409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003198
1048	NC_012970	GCA	2	6	66422	66427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003198
1049	NC_012970	CTT	2	6	66450	66455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254003198
1050	NC_012970	GGA	2	6	66477	66482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003198
1051	NC_012970	CTGCA	2	10	66489	66498	20 %	20 %	20 %	40 %	254003198
1052	NC_012970	CGG	2	6	66516	66521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003198
1053	NC_012970	ATG	2	6	66539	66544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003198
1054	NC_012970	GAA	2	6	66575	66580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003198
1055	NC_012970	AAG	2	6	66584	66589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003198
1056	NC_012970	GAA	2	6	66593	66598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003198
1057	NC_012970	GAT	2	6	66605	66610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003198
1058	NC_012970	TGTGC	2	10	66623	66632	0 %	40 %	40 %	20 %	254003198
1059	NC_012970	ATA	2	6	66695	66700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003198
1060	NC_012970	GGA	2	6	66803	66808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254003198
1061	NC_012970	A	6	6	66857	66862	100 %	0 %	0 %	0 %	254003198
1062	NC_012970	TGG	2	6	66863	66868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003198
1063	NC_012970	GAA	2	6	66985	66990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003198
1064	NC_012970	AAG	2	6	67005	67010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003198
1065	NC_012970	ATG	2	6	67025	67030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003198
1066	NC_012970	CCTGCT	2	12	67043	67054	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254003198
1067	NC_012970	GGC	2	6	67090	67095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003198
1068	NC_012970	AG	3	6	67096	67101	50 %	0 %	50 %	0 %	254003198
1069	NC_012970	AAG	2	6	67167	67172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003198
1070	NC_012970	TGGA	3	12	67222	67233	25 %	25 %	50 %	0 %	254003198
1071	NC_012970	CAA	2	6	67445	67450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003198
1072	NC_012970	GCC	2	6	67499	67504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254003198
1073	NC_012970	TGG	2	6	67540	67545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003198
1074	NC_012970	TGA	2	6	67697	67702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003199
1075	NC_012970	GCG	2	6	67894	67899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003199
1076	NC_012970	GTC	2	6	67995	68000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003199
1077	NC_012970	CAG	2	6	68023	68028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003199
1078	NC_012970	GCA	2	6	68031	68036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003199
1079	NC_012970	ACA	2	6	68044	68049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003199
1080	NC_012970	CTG	2	6	68123	68128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003200
1081	NC_012970	GAT	2	6	68182	68187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003200
1082	NC_012970	TTG	2	6	68240	68245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003200
1083	NC_012970	AAACA	2	10	68333	68342	80 %	0 %	0 %	20 %	254003200
1084	NC_012970	AGC	2	6	68343	68348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003200
1085	NC_012970	ACATTC	2	12	68414	68425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003200
1086	NC_012970	ATG	2	6	68468	68473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003200
1087	NC_012970	AT	3	6	68530	68535	50 %	50 %	0 %	0 %	254003200
1088	NC_012970	GATAAA	2	12	68602	68613	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	254003200
1089	NC_012970	CT	3	6	68724	68729	0 %	50 %	0 %	50 %	254003200
1090	NC_012970	CAT	2	6	68787	68792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003200
1091	NC_012970	ACG	2	6	68827	68832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003200
1092	NC_012970	ATC	2	6	68854	68859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003200
1093	NC_012970	GAA	2	6	68877	68882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003200
1094	NC_012970	TTA	2	6	68885	68890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254003200
1095	NC_012970	C	6	6	68901	68906	0 %	0 %	0 %	100 %	254003200
1096	NC_012970	CGA	2	6	68958	68963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003200
1097	NC_012970	ATG	2	6	69025	69030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003200
1098	NC_012970	ACA	2	6	69103	69108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254003200
1099	NC_012970	CAT	2	6	69303	69308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254003200
1100	NC_012970	GAA	2	6	69383	69388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003200
1101	NC_012970	AGT	2	6	69390	69395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003200
1102	NC_012970	GAA	2	6	69418	69423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254003200
1103	NC_012970	AAT	2	6	69442	69447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254003200
1104	NC_012970	TTG	2	6	69563	69568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254003200
1105	NC_012970	GGT	2	6	69771	69776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254003201
1106	NC_012970	GAT	2	6	69848	69853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003201
1107	NC_012970	TGC	2	6	69890	69895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003201
1108	NC_012970	GT	3	6	70027	70032	0 %	50 %	50 %	0 %	254003201
1109	NC_012970	GAT	2	6	70112	70117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003201
1110	NC_012970	TGGCTA	2	12	70143	70154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254003201
1111	NC_012970	TATT	3	12	70186	70197	25 %	75 %	0 %	0 %	254003201
1112	NC_012970	AATG	2	8	70268	70275	50 %	25 %	25 %	0 %	254003201
1113	NC_012970	GTA	2	6	70276	70281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003201
1114	NC_012970	GCA	2	6	70340	70345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003201
1115	NC_012970	TTCG	2	8	70405	70412	0 %	50 %	25 %	25 %	254003201
1116	NC_012970	GCA	2	6	70428	70433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254003201
1117	NC_012970	CAGA	2	8	70459	70466	50 %	0 %	25 %	25 %	254003201
1118	NC_012970	GGC	2	6	70503	70508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254003201
1119	NC_012970	TGA	2	6	70511	70516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003201
1120	NC_012970	TCAAA	2	10	70562	70571	60 %	20 %	0 %	20 %	254003201
1121	NC_012970	AGT	2	6	70583	70588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003201
1122	NC_012970	TCG	2	6	70609	70614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254003201
1123	NC_012970	G	6	6	70638	70643	0 %	0 %	100 %	0 %	254003201
1124	NC_012970	ATG	2	6	70644	70649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003201
1125	NC_012970	ATG	2	6	70653	70658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254003201
1126	NC_012970	A	6	6	70679	70684	100 %	0 %	0 %	0 %	254003201
1127	NC_012970	ATTA	3	12	70693	70704	50 %	50 %	0 %	0 %	254003201
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.